“手搓测序仪”进阶-液路系统揭秘

上期,我们在业内首次开拆NGS测序仪:

从零开始手搓高通量测序仪


测序平头哥第2弹,为大家深度解密测序仪各大内部系统。

今天解密的是测序系统中最重要模块之一:

液路系统。

结合大家已经比较熟悉的illumina测序原理,

试想一下,液路系统起到什么功能?

以illumina测序原理为例,测序反应主要包括:

(1)桥式PCR扩增,DNA簇形成

将构建好的文库加载到流动池上。在适当的条件下,DNA片段会与流动池上的寡核苷酸结合,然后通过桥式PCR扩增,形成密集的DNA簇(cluster)。

(2)测序反应

包括:测序引物结合与碱基延伸、荧光检测与信号处理、修饰基团切除与下一个循环。

如上,在整个测序反应过程中,会涉及含测序引物、dNTP、聚合酶、缓冲液、洗脱液等一系列试剂的传输与控制。

液路系统的核心功能,即通过合理的系统设计和动力元件的调控,精确控制试剂的流速和流量确保每种试剂都能准确无误地到达指定位置,从而构建合适的反应环境。

为实现该功能,液路系统的工作模块包括:

将上述功能简化,可直观展示为:

结合工作动画来看:

液路系统的具体工作过程为:

加载试剂盒和缓冲液盒 → SMA选择不同的试剂和缓冲液 → 进样泵开始吸取试剂到Flowcell内 → 进样泵吸取废试剂,排放到废液池中。

下面,分模块介绍。

(1)FAM-液路自动化模块

FAM位于测序仪中间的最下方,提供试剂切换功能。FAM下方放置测序试剂盒,FAM依靠内部的SMA,选择不同的试剂。

SMA在FAM的内部,左侧的试剂针在加载时可以穿透试剂盒。

SMA很少会出现问题,但如果液路压力上不去,排查过泵和FCLM等所有关键位置后,依然没有找到问题的话,就需要检查SMA了。

SMA内部的旋转阀如磨损严重,会导致密封不严,压力打不上去,则需要维修泵体。

(2)BSM-缓冲液模块

BSM模块可以自动升降,用来吸取缓冲液,通过SMA最后进入到Flowcell内。

(3)FCLM-Flowcell加载模块

FCLM是位于液路系统和光路系统中间的模块,

以图例机型为例,在FCLM上有2个manifold,每个manifold上有4个小孔,对应了Flowcell的4条通道。

如果液路系统故障,可能导致某条lane无法输送试剂,造成测序失败。

(4)Syringe & pump-进样泵模块

进样泵模块是液路试剂流动的动力来源,它位于液路系统的尾部,不论是吸取试剂还是缓冲液,它都参与其中。

进样泵模块出现最多的问题就是压力上不去,一般情况是管路有松动,或者有漏气。

(5)压力传感器

它会实时监测液路的压力。当实验出现问题时,可以通过压力传感器记录的数据,来判断液路有无故障。

(6)废液池

它位于缓冲液仓的下方,所有的液体最后都会流向废液池。

详细视频介绍,请参考:

NGS测序仪液路系统(上)

NGS测序仪液路系统(下)

下期,将给大家介绍:

NGS测序仪光路系统。

相关教学科普视频,可以关注“基因江湖”视频号合集,我们将会陆续发布:

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